故事舞台被设置在断崖绝壁，四面环海的孤岛监狱“鬼灯城”。在本篇故事中，鸣人因被指控杀害云隐和岩隐的上忍，及暗杀雷影未遂被投入监狱。“鬼灯城”城主无为拥有着超强的禁固术，鸣人不但因城主“无为”的最强禁锢术失去了所有力量，还处处遭人暗杀，他是否能活着证实自己的清白？笼罩这座岛的阴谋和秘密究竟是什么？为了得到真相，鸣人与同伴们将奋起战斗！而鸣人如何从监牢逃脱找到陷害自己的人，从而证明自己的清白则是更大的悬念。