故事发生在1927年，电影第一部结尾，纽特揭露黑巫师盖勒特·格林德沃（约翰尼·德普饰）真面目之后的几个月，舞台从纽约移到伦敦，然后再到巴黎。巫师世界越来越黑暗，逃亡中的格林德沃麾下招来了更多小喽啰，再次掀起风浪 。能阻止他的可能就是他曾经最亲密的恋人阿不思·邓布利多（裘德·洛饰），而邓布利多也需要他的学生纽特（埃迪·雷德梅恩饰）的帮助。最终邓布利多和纽特联手一起对付格林德沃。